人稱柯導、柯師傅，現任《公共電視》新聞部製作人。1962年出生於彰化伸港，1980年代以打工方式購買第一部相機，開始記錄台灣自然景貌，而後任職媒體，主跑政經與社運。1990年，因目睹嘉義東石網寮村因颱風淹水39天卻缺乏媒體關注之慘況，決心專注耕耘環境新聞，並開始參與電子媒體。1993年起在平面媒體撰寫環境議題專欄，前後長達12年，共累積超過30萬字的台灣環境田野調查資料。1998年他進入《公視》新聞部服務至今，已累積20多萬張環境紀錄圖像、27部環境紀錄片作品。

紀錄片作品有《來自斷層的消息》（2000）、《烏坵》（2002）、《阿瑪斯》（2003）、《彌猴列傳》（2004）、《記憶珊瑚》（2004）、《天大地大》（2005）、《產房》（2006）、《天堂路》（2007）、《前進南極》（2008）、《夢想巔峰》（2009）、《登峰造極》（2009）、《福爾摩沙對福爾摩沙》（2010）、《海岸群像》（2011）、《黑》（2013）、《空襲警報》（2013）、《餘生共游》（2014）、《命水》（2015）、《水戰》（2015）、《海》（2016），《前進》（2017）等。

亦曾發表攝影個展如《意念的表象》（1990）、《再見海洋》（1998）、《海洋台灣》（2000）等，並著有《山美－達娜伊谷的傳奇》（2002）、《台灣水資源脈絡》（2003）、《我們的島》（2006）、《我們的島：台灣三十年環境變遷全紀錄》（2018）等書。

1997年起，柯金源入圍與獲得國內外超過100個重要獎項，其中包括個人入圍7次電視金鐘獎、獲頒攝影與非戲劇導演3座金鐘獎，以「動物救援」獲得NPO媒體報導獎電視報導首獎，《獼猴的戰爭與和平》更同時獲得美國CINE金鷹獎、美國廣播電視博物館永久典藏、美國蒙大拿國際野生動物影展IWFF 2項大獎與9項優異獎。近年代表作為紀錄片《海》，記錄台灣近20幾年來的海洋環境變遷，全片沒有旁白與配樂，以質樸的影像敘事深入海洋。多部作品入圍加拿大、瑞典、印度、新加坡、泰國、中國、西班牙等各國相關影展。