18日晚間8點左右，公投結果正式出爐，「重啟核四」、「禁止萊豬進口」、「公投綁大選」、「三接遷離大潭藻礁」4大公投案皆因同意票未達門檻而遭否決，其中「重啟核四」正反雙方差距最大，「公投綁大選」案有效同意票最多，但仍未破400萬大關。

根據《公投法》規定，同意票超過投票權人數四分之一、且多於不同意票，即為通過。此次公投具投票權人數為1,982萬5,468人，至少需拿到495萬6,367票才算通過。最後全國投票人數為814萬左右，投票率約在41%，不僅沒有任何一案的有效同意票達到通過門檻，且4項公投的不同意票都大於同意票、超過400萬票。

在公投結果大致底定後，國民黨主席朱立倫與總統蔡英文前後召開記者會。朱立倫表示，國民黨是為了民眾關心的民生議題打拼，相信深化民主的道路不會中斷，他會勇敢走下去；他身為主席要向全體國民黨員表達歉意，也會承擔責任；並呼籲同志，「要把戰友找回來，不要找戰犯。」

蔡英文總統則強調，這是公民意志展現，公投沒有誰輸誰贏的問題，只有國家未來怎麼走的問題。她並指出這次公投結果傳達了4個明確訊息：台灣人民希望走向世界，願意積極參與國際；人民支持能源轉型，期待穩定供電，並且維持經濟成長的動能；人民重視經濟環保雙贏；人民期待公共政策資訊透明被理性討論。

本案同意方認為，核能低碳且可提供穩定電力，反對方則質疑核能安全性以及核廢料處理問題。

領銜提案的核能流言終結者創辦人黃士修晚間發表聲明表示遺憾，他認為，「重啟核四公投、未通過造成的影響有，中央政府更不可能處理核廢料，新北市長侯友宜對公投案異常消極，造就了核廢料永遠放在新北市的政治現實；核四工程問題無法查明；中南部每年要多燒730萬噸煤，空汙加劇；台灣面臨嚴重缺電，應考慮核二、核三延役，或在核四廠區新建小型模組化反應爐。」

反對重啟核四的全國廢核行動平台對於公投結果則平靜看待，晚間7點召開聯合記者會時沒有顯露太大情緒，地球公民基金會副執行長蔡中岳表示，這次結果代表走向非核家園是台灣社會共識，「接下來核四不能回到原來封存狀態，要拆除。」他也提醒，不要把這次公投判斷成政黨大勝利，民間團體會繼續監督執政黨能源發展政策，推動再生能源。

長期關注核能的綠色公民行動聯盟祕書長崔愫欣強調，反對核四重啟的共識要在立法院落實，2年後不知道會不會有人再提核四公投，朝野在公投後要好好討論核四廠房、財務處理、土地如何使用，編列成行政法案，趕快進行相關程序，不要讓核四幽靈繼續盤據在台灣上空。

由於《公投法》規定2年內不得就同一案重新提案，且公投必須在奇數年舉行，意即下一次若要重新公投核四，最快得等到2025年，雖然民團呼籲政府在這期間拆除核四，不過中原大學財經法律學系副教授林春元日前接受《報導者》採訪時表示，不通過後核四維持封存現狀是比較可能的情況；至於政府會不會貫徹非核家園政策而拆除核四廠，並非本次公投所能回答，而是政策考量。

行政院晚間8點召開記者會，經濟部長王美花表示，公投已經清楚表達重啟核四困難重重，後續會督導台電針對資產極大化，也跟地方溝通做好相關規劃。後續能源轉型路徑都會跨部會討論，明年（2022）將提出能源轉型路徑。

台灣在去年（2020）宣布開放含萊克多巴胺（簡稱萊劑，俗稱瘦肉精）豬肉進口，當時引起不小反彈，國民黨立委林為洲在2020年9月23日提案，禁止進口含萊克多巴胺豬肉。國民黨在此案強打食安問題，民進黨則以影響國際貿易為由強力動員，選前各民調即呈現五五波拉鋸。

前食品藥物管理局局長、陽明大學藥物科學院院長康照洲日前接受《報導者》受訪時表示，反萊豬一案不通過後的重點會是邊境和源頭把關，現在地方衛生局人力吃緊，從市面抽檢相對沒有效率，必須從源頭就開始追蹤，才能事半功倍；民眾也該有完全的知情和選擇權，若能在源頭就將含萊劑豬肉和不含萊劑豬肉分開進口，民眾才能清楚選擇，也不會變成完全抵制美國豬肉。

民進黨在選前不斷強調，開放萊豬是台灣加入台美貿易暨投資架構協定（Trade and Investment Framework Agreement, TIFA）、跨太平洋夥伴全面進步協定（Comprehensive and Progressive Agreement for Trans-Pacific Partnership, CPTPP）的門票。公投前夕，民進黨在凱達格蘭大道的大型公投說明會上，蔡英文總統將民調最危險、可能通過的「反萊豬公投」視為「重中之重」，並懇請民眾理解國家處境，克服中國的政治干擾，守住台灣防線，投下不同意票。

公投不通過後，未來政府如何回應民眾期待將是觀察重點。台灣智庫副執行長董思齊認為，接下來政府要清楚針對CPTPP做準備，跟民眾說明時間規劃、進度和目標，「我們現在計劃什麼時間點、能跟哪些國家溝通到什麼程度？達到什麼目標？」規劃出來後才有利於後續加入這些組織。

本案的反方認為公投綁大選將造成選務加重，甚至出現邊投票邊開票的亂象；正方則認為這是中選會的規劃跟執行問題，綁大選有助投票率。

公投綁大選不通過，代表《公投法》將維持現行規定，從今年（2021）開始，每兩年進行一次公投，亦即奇數年舉行公投，偶數年舉行公職人員選舉。

政治大學法律學系副教授林佳和日前接受《報導者》訪問時表示，《公投法》仍有三個面向應該修改調整：

由於本案攸關能源轉型與環境生態議題，選前台灣環保團體即產生分裂，同意遷離者主張，三接不應選在有千年生態價值的大潭藻礁海域；反對遷移者則認為，三接進度延宕可能拖慢減煤期程。

藻礁公投推動聯盟18日在荒野保護協會總部觀看開票結果，晚間6點半、開票約8成時，提案人潘忠政發表聲明表示「很難受、很難受，但必須謙卑地接受選舉結果」，該聯盟將持續關注外推案的環評程序，以及三接工程對藻礁生態系的影響。他也質疑，政府口頭宣示三接只有兩座儲槽，但中油今年的預算書仍有擴建儲槽的預算，「難道（執政黨）是想頭過身就過嗎？」，朝野政黨應該否決此預算，阻擋三接擴建。

潘忠政坦言，對於結果「有點失望」，公投結果和之前民調有很大差距，青年連署踴躍但投票不明顯，關鍵在於政府使用龐大資源放出很多假資訊，「鋪天蓋地丟進他們（指青年）腦袋後，有很多懷疑，」最後選擇不投票，他指這些都是「非常不公平的現象」。

至於三接將如何發展？潘忠政表示「會非常無法預測」，外推案的環評如果最後沒有通過，「是不是要用原方案（即2018年通過環評的版本）？那全國是不是要再做一次公投？⋯⋯所有因為外推方案投下這一票的人，他們是不是要抗議？」

經濟部長王美花在行政院記者會上則強調，三接可以穩定減碳、減空汙，也可以保護藻礁，後續會督導中油穩定供電跟保護藻礁。正在進行環評程序中的外推案也會盡快補件，順利的話三接能在2025年6月如期上線。至於有沒有可能擴建三接的儲槽？王美花表示，三接後續的相關規劃，「會看整體需求，目前兩個儲槽可以供我們使用。」

此次藻礁公投造成環團分裂，未來如何修補裂痕也是外界關注焦點。不同意三接遷離的地球公民基金會副執行長蔡中岳指出，這次公投不能說是哪一方勝利，能源轉型過程中，生態保育、空氣汙染、選址、社會溝通等是未來台灣艱困的課題，希望政府能良善溝通，降低生態衝擊，民團會持續扮演監督角色。

上次2018年公投綁大選，投票率皆約55％，10案公投案通過7案。今天是台灣第一次公投不綁大選，投票率僅約41％，4案皆未達通過門檻而遭否決。

林佳和受訪時表示，上次公投因為綁大選而複雜、公投議題多也沒時間好好討論，「是很糟糕的公投。」瑞士全國性公投投票率平均不到4成，「台灣今天的投票率才算是正常⋯⋯（國家體制）愈是共識決，全國公投投票率愈低，因為人民不相信公投（相較於代議政治）會通往一個好的結果。」

林佳和分析，今天投票結果比較接近藍綠基本盤，至於中間選民為何沒投票？一種可能是因為公投議題過度複雜，沒有信心做出決定而卻步，另種解讀是中間選民認為這些議題應該交給代議政治解決，不該由公投決定。

董思齊則觀察，這次選舉變成對政府信任和不信任投票，單純用簡單的政治論述，例如幾個同意、幾個不同意，「沒有促進公民對這些事務的認知和理解，會很可惜。」如何讓公投提案問題更好，討論更充實，有更長的時間匯集民意，是這次公投後可以再思考的。